Кадастр объектов растительного мира
Всего в заказнике произрастает более 1000 видов сосудистых растений, много мхов, лишайников и грибов. В первозданном виде сохранились леса на северных склонах Карцинского хребта, но большая часть лесов Черных гор (Лесистого и Пастбищного хребтов) пройдена рубками. Северные склоны этих хребтов покрыты лесами из бука восточного и граба кавказского, южные — заняты сообществами дуба и лещины. По днищам ущелий растут серо- и черноольшаники. Кустарниковые заросли представлены кизилом, шиповником, черникой кавказской и азалией (рододендроном желтым) а на верхнем пределе леса – рододендроном кавказским. На полянах, опушках и лугах встречаются заросли высокотравья — дудника, борщевика и ядовитого аконита высотой более двух метров. В широколиственных лесах встречаются рощи третичных реликтов – тиса ягодного, падуба колхидского, а также местообитания плюща колхидского.
У южного подножия Скалистого хребта произрастают реликтовые сухолюбивые сосняки. Среди зарослей можжевельника встречаются патриархи, например возле святилища
